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ITP/TOP拓扑文件 今日: 0|主题: 53|排名: 4 

本模块 GROMACS 拓扑文件（ITP/TOP） 相关交流，用于讨论拓扑生成、参数修改、力场配置、报错排查等问题，帮助大家正确构建与调试模拟体系。
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石墨烯和Ti3C2的ITP参数 sxugm 2026-4-7 3187 lauthirteen 2026-4-16 21:13
警告，范德华半径未指定 New 模小助 7 天前 144 admin 7 天前
如何解决石墨烯在聚合物体系中表现得太柔软的问题呢？ New 模小助 6 天前 138 admin 6 天前
posre.itp怎么使用？ New 模小助 4 天前 125 admin 4 天前
带结晶水的GROMACS模拟后结晶水断键 New 模小助 前天 20:55 17 admin 前天 22:00
求助：Residue' not found in residue topology database 新人帖 双双 2026-3-10 1209 admin 2026-3-10 14:49
Atom X in residue YYY not found in rtp entry?? 双双 2026-3-10 1125 admin 2026-3-10 14:50
gromacs时候出现下面错误：Invalid order for directive 'atomtypes' 双双 2026-3-10 1303 admin 2026-3-10 14:50
错误：No such moleculetype "XXX"。请问大家应该如何解 双双 2026-3-10 1160 admin 2026-3-10 14:55
错误：Atomtype X not found? 新人帖 qaz 2026-3-10 1252 admin 2026-3-10 14:54
请问大家应该如何解决呢?Atom index n in position_restraints out of bounds (1-X)。 qaz 2026-3-10 1202 admin 2026-3-10 14:54
小白求助：Found a second defaults directive file qaz 2026-3-10 1127 admin 2026-3-10 14:51
我运行 GROMACS 时出现错误？ qaz 2026-3-10 1147 admin 2026-3-10 14:53
找不到SOL组 qaz 2026-3-10 1107 admin 2026-3-10 14:52
[GROMACS] Moleculetype "XXX" is redefined? qaz 2026-3-10 1114 admin 2026-3-10 14:52
请教：GROMACS 中金属原子的 top 文件要怎么写 Vex 2026-3-13 1197 lauthirteen 2026-3-13 15:05
求助：如何使用 Sobtop 创建铁硫蛋白中铁硫簇 [Fe2S2] 的 GROMACS 拓扑文件 新人帖 Quasar 2026-3-13 1195 lauthirteen 2026-3-13 15:07
刘建川・GROMACS | TOP/ITP文件讲解视频 admin 2026-3-16 1292 HeliumArgon 2026-8-12 12:59
用 CGenFF 处理 Mol2 文件用于 GROMACS 拓扑时失败，该如何处理？ 新人帖 qianwen 2026-3-18 1231 lauthirteen 2026-3-19 10:10
拓扑文件报错? 新人帖 baomis 2026-3-18 1164 lauthirteen 2026-3-19 10:09
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