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ITP/TOP拓扑文件今日: 0|主题: 22|排名: 2

本模块 GROMACS 拓扑文件（ITP/TOP）相关交流，用于讨论拓扑生成、参数修改、力场配置、报错排查等问题，帮助大家正确构建与调试模拟体系。

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石墨烯和Ti3C2的ITP参数 New	sxugm 7 天前	215	sxugm 4 天前
GROMACS 拓扑报错：ITP 文件找不到 / 重复定义分子类型	reac 2026-4-3	115	lauthirteen 2026-4-3 10:44
GROMACS 运行报错：Undefined atom type 原子类型未定义	reac 2026-4-3	110	lauthirteen 2026-4-3 10:44
各位老师同学有个 OPLSAA 力场的小问题想请教大家：	licheng 2026-3-25	128	lauthirteen 2026-3-25 12:37
求助！GROMACS2024.1 做蛋白 - 小分子模拟，top 文件错误导致能量最小化失败，该怎么	pcc 2026-3-25	122	lauthirteen 2026-3-25 12:03
Ambertool和acpype安装和使用	lauthirteen 2026-3-19	067	lauthirteen 2026-3-19 19:28
生成GLYCAM力场的纤维素(多糖)及其衍生物TOP文件	lauthirteen 2026-3-19	033	lauthirteen 2026-3-19 11:45
用 CGenFF 处理 Mol2 文件用于 GROMACS 拓扑时失败，该如何处理？	qianwen 2026-3-18	140	lauthirteen 2026-3-19 10:10
拓扑文件报错?	baomis 2026-3-18	136	lauthirteen 2026-3-19 10:09
刘建川・GROMACS \| TOP/ITP文件讲解视频	admin 2026-3-16	038	admin 2026-3-16 11:01
求助：如何使用 Sobtop 创建铁硫蛋白中铁硫簇 [Fe2S2] 的 GROMACS 拓扑文件	Quasar 2026-3-13	141	lauthirteen 2026-3-13 15:07
请教：GROMACS 中金属原子的 top 文件要怎么写	Vex 2026-3-13	139	lauthirteen 2026-3-13 15:05
错误：No such moleculetype "XXX"。请问大家应该如何解	双双 2026-3-10	140	admin 2026-3-10 14:55
错误：Atomtype X not found?	qaz 2026-3-10	139	admin 2026-3-10 14:54
请问大家应该如何解决呢?Atom index n in position_restraints out of bounds (1-X)。	qaz 2026-3-10	134	admin 2026-3-10 14:54
我运行 GROMACS 时出现错误？	qaz 2026-3-10	123	admin 2026-3-10 14:53
[GROMACS] Moleculetype "XXX" is redefined?	qaz 2026-3-10	119	admin 2026-3-10 14:52
找不到SOL组	qaz 2026-3-10	121	admin 2026-3-10 14:52
小白求助：Found a second defaults directive file	qaz 2026-3-10	122	admin 2026-3-10 14:51
gromacs时候出现下面错误：Invalid order for directive 'atomtypes'	双双 2026-3-10	147	admin 2026-3-10 14:50

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