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求助！！！！！！！！Zeo++画连通性拓步结构的问题	lucksanmu 2026-5-11	1319	lauthirteen 2026-5-26 21:38
通过 ATB 网站构建小分子的拓扑文件后，执行以下 grompp 命令：gmx grompp -f em.mdp	xuanyx 2026-4-30	1302	lauthirteen 2026-5-26 21:37
基于Martini力场的蛋白质粗粒化建模方法	EchoMist 2026-5-21	1189	lauthirteen 2026-5-26 21:36
分子模拟力场选择的相关问题咨询	ZhaoLiu_xyz 2026-5-22	1205	lauthirteen 2026-5-25 09:32
分子模拟中缺失的力场参数的获取与处理方案咨询	LiHua_888 2026-5-22	1153	lauthirteen 2026-5-25 09:31
执行晶胞定义时，出现警告：“WARNING: Bad box in file complex.gro”，这是什么原因	kuaij 2026-4-30	1246	lauthirteen 2026-5-12 09:58
求组：关于金属铋的力场	Lisy 2026-4-22	1202	lauthirteen 2026-4-22 10:03
复合物体系拓扑合并后，Total charge 不为整数，grompp 警告	sshipi 2026-4-15	1215	lauthirteen 2026-4-17 11:11
TOP 文件力场包含顺序不对，出现 Missing proper dihedrals	zchux 2026-4-15	1164	lauthirteen 2026-4-17 11:09
多次 include ITP 文件，出现 Duplicate moleculetype 重复定义	ehsw 2026-4-15	1170	lauthirteen 2026-4-17 11:08
小分子 ITP 导入后报错：Undefined atom type	renee 2026-4-15	1152	lauthirteen 2026-4-17 11:07
生成GLYCAM力场的纤维素(多糖)及其衍生物TOP文件	lauthirteen 2026-3-19	0452	lauthirteen 2026-4-17 10:50
石墨烯和Ti3C2的ITP参数	sxugm 2026-4-7	3187	lauthirteen 2026-4-16 21:13
模拟一个小分子在PMMA聚合物中的环境,如何确定初始结构以及初始的参数?	fens 2026-4-16	1102	lauthirteen 2026-4-16 20:44
GROMACS 拓扑报错：ITP 文件找不到 / 重复定义分子类型	reac 2026-4-3	1106	lauthirteen 2026-4-3 10:44
GROMACS 运行报错：Undefined atom type 原子类型未定义	reac 2026-4-3	1179	lauthirteen 2026-4-3 10:44
各位老师同学有个 OPLSAA 力场的小问题想请教大家：	licheng 2026-3-25	1195	lauthirteen 2026-3-25 12:37
求助！GROMACS2024.1 做蛋白 - 小分子模拟，top 文件错误导致能量最小化失败，该怎么	pcc 2026-3-25	1172	lauthirteen 2026-3-25 12:03
Ambertool和acpype安装和使用	lauthirteen 2026-3-19	0556	lauthirteen 2026-3-19 19:28
用 CGenFF 处理 Mol2 文件用于 GROMACS 拓扑时失败，该如何处理？	qianwen 2026-3-18	1231	lauthirteen 2026-3-19 10:10

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