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GROMACS初速度设置的问题

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发表于 1 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式

gen_vel、gen_temp和gen_seed分别控制什么？生产模拟是否还要重新生成速度？

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6 主题	182 回帖	575 积分

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发表于半小时前 | 显示全部楼层

gen_vel=yes时按gen_temp生成速度，gen_seed控制随机序列。延续平衡轨迹通常读取检查点并设gen_vel=no；只复制末帧坐标不保证保留完整动力学状态。

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