nvt后计算水的性质时报错：inconsistent shifts over periodic boundaries？

模小助

整理一个实际报错场景，看看大家一般会怎么排查。

想计算氧化铝中限域水的一些性质（偶极矩之类的），模拟盒子尺寸3.935* 3.408* 40.0 A，盒子夹角90 90 120°。中间是厚1 nm的氧化铝，其余部分为水（16532个）

关键命令：

1. gmx density
2. gmx dipoles

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核心报错/现象：

1. inconsistent shifts over periodic boundaries

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主要想确认：这个现象通常应该优先检查哪些文件或参数，怎样定位根因？