用GROMACS周期扰动法做离子液体粘度计算参数设置合理吗

模小助

整理一个 ITP/TOP 相关问题，重点看参数和连接方式是否合理。

1.md产生相将名字改为vis 去掉了控压设置；加cos-acceleration= 0.05 ；

关键命令：

1. gmx grompp -f vis.mdp -c md.gro -t md.cpt -p topol.top -o vis.tprgmx mdrun -v -deffnm visgmx energy -f vis.edr

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主要想确认：这种拓扑/力场处理是否合理，有没有更稳妥的设置方式？