模拟报错今日: 0|主题: 52|排名: 1

本模块专为 GROMACS 分子动力学模拟用户提供交流平台，用于分享模拟过程中遇到的问题、交流经验、共同排查与解决各类报错及运行故障。

新窗全部主题最新热门热帖精华更多 \| 显示置顶		作者	回复/查看	最后发表


在使PLUMED对GROMACS的轨迹文件做元动力学时，必须将命令写一起吗 New	模小助昨天 09:35	15	admin 昨天 11:15
gmx报错提示CUDA error #700？ New	模小助前天 10:05	112	admin 前天 12:15
进行grompp时警告，不知道是否忽视+mdrun时怎么能跑满20线程？ New	模小助 3 天前	114	admin 3 天前
以GPU跑MD时，thread不能pin到CPU core上（提示thread pinning disabled） New	模小助 4 天前	118	admin 4 天前
gmx hbond计算氢键出现边缘网格内存分配缺陷错误：415/905段错误 (核心已转储)？ New	模小助 5 天前	121	admin 5 天前
GROMACS出现错误，提示在.mdp文件中的Group，在输入文件中匹配不到？ New	模小助 6 天前	138	admin 6 天前
GROMACS探究盐溶液对多糖的影响进行nvt时LINCS WARNING New	模小助 7 天前	143	admin 7 天前
GROMACS合并轨迹后运行RMSD	模小助 2026-9-22	152	admin 2026-9-22 11:45
GROMACS转换轨迹格式时出现错误？	模小助 2026-9-21	181	admin 2026-9-21 12:25
gmx mdrun调用GPU失败？	模小助 2026-9-20	177	admin 2026-9-20 10:30
模拟了蒙脱石和水/甲烷体系，但trjconv输出轨迹时无法将蒙脱石放在盒子内部	模小助 2026-9-19	170	admin 2026-9-19 11:55
超过5位数相同残基的gro文件如何运行？	模小助 2026-9-18	194	admin 2026-9-18 11:10
蛋白核酸配体体系建模加完水以后出现了问题	模小助 2026-9-17	191	admin 2026-9-17 12:20
GPU加速出错问题	模小助 2026-9-16	187	admin 2026-9-16 11:55
石墨烯md模拟力场建立过程中出了问题	模小助 2026-9-15	1118	admin 2026-9-15 12:25
使用GROMACS将膜插入蛋白质时，输入控制文件membed.dat时失败？	模小助 2026-9-14	1139	admin 2026-9-14 11:15
我的分子动力学模拟修复和不修复蛋白都跑不通AMBER力场	模小助 2026-9-13	1142	admin 2026-9-13 11:40
GROMACS中的rmsd和rmsf的	模小助 2026-9-12	1143	admin 2026-9-12 12:25
使用GROMACS的MetaD对蛋白配体复合物做采样时，遇到segment default应该如何解决？	模小助 2026-9-11	1152	admin 2026-9-11 12:15
nvt后计算水的性质时报错：inconsistent shifts over periodic boundaries？	模小助 2026-9-10	1145	admin 2026-9-10 12:40

12 3 / 3 页下一页

返回发新帖

快速发帖

|模拟之家-SimuHome ( 蜀ICP备2023003244号-3 )

GMT+8, 2026-9-30 05:09 , Processed in 0.009618 second(s), 10 queries .

		自动登录	找回密码
密码			立即注册

模拟报错 今日: 0|主题: 52|排名: 1

快速发帖

浏览过的版块

模拟报错今日: 0|主题: 52|排名: 1