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本模块用于 GROMACS 模型构建 相关交流,包括蛋白 / 小分子 / 复合物建模、盒子搭建、溶剂化、加离子、初始结构处理等操作讨论与问题解决。
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求助:CCDC 1495519 有机晶体 CIF 导入 MS 异常(硝基键级错 / 原子重叠),如何正确 新人帖 lswdteu 2026-5-29 1284 lauthirteen 2026-6-3 10:52
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