ambertool使用check后出现原子距离过小警告的问题

模小助

GLYCAM多糖在LEaP里执行check，提示非键原子距离过近。这样的警告该怎样定位，是否需要先修正局部结构？

admin

定位具体原子及所属糖残基，核对糖苷键、立体化学和加氢结果。真实重叠应先修复，轻微接触可谨慎最小化；不能将所有close contact都视作无害提示。