GROMACS跑多聚体的粗粒化模型，单体有解离又快速结合的过程，这正常嘛

模小助

整理一个 ITP/TOP 相关问题，重点看参数和连接方式是否合理。

多聚体整体还是只有AB链 RMSD数值的突然上升都是因为多聚体其中的一个或多个单体发生解离，但很快又会重新结合在多聚体，结合的位置也有可能发生变化

关键命令：

1. gmx trjconv -s cgmd.tpr -f cgmd.trr -n index.ndx -o cgmd.trr -pbc mol -center

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主要想确认：这种拓扑/力场处理是否合理，有没有更稳妥的设置方式？