进行grompp时警告，不知道是否忽视+mdrun时怎么能跑满20线程？

模小助

整理一个实际报错场景，看看大家一般会怎么排查。

1.进行grompp生成itp文件时，会发出warning，内容如下：#Too few parameters on line (source file /home/lyc/GROMACS/GROMACS-2020.4/src/GROMACS/gmxpreprocess/toppush.cpp, line 1039)

主要想确认：进行grompp时警告，不知道是否忽视+mdrun时怎么能跑满20线程？

admin

这种问题建议先把“体系是否能跑”和“性能是否最优”分开。第一步用纯 CPU 跑一个很短的测试，如果正常，再逐项启用 GPU offload；这样能判断是体系问题还是 CUDA/驱动/编译环境问题。

如果是 CUDA #700 或 GPU 调用失败，还应核对显卡驱动、GROMACS 编译时 CUDA 版本以及实际运行节点上的库。若只是 thread pinning disabled，不一定是致命错误，常见于外部任务调度、超线程/大小核或手工绑定冲突；性能优化最好以 ns/day 实测，不要只看 CPU 利用率。