gmx solvate 溶剂化报错，分子超出盒子，无法加水

lingc

我是小白，请问各位大佬用gmx editconf搭建盒子后，执行gmx solvate溶剂化，提示原子超出盒子，溶剂化失败，如何解决


gmx editconf -f complex.gro -o box.gro -c -d 1.0 -bt cubic
gmx solvate -cp box.gro -cs spc216.gro -o solv.gro -p topol.top

lauthirteen

把错误截图贴上来看看