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油/水/表面活性剂界面张力模拟中盒子持续拉长,参数该怎么调?

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发表于 1 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式
整理一个平衡/生产阶段的参数问题,结果对设置比较敏感。

我在测定一个表面活性剂对油水界面体系的表面张力降低程度,在做固定x,y轴,允许z轴变化的npt模拟时发现体系会一直被拉长,以下是我的体系和我用的mdp文件,请问这应该如何处理?

主要想确认:油/水/表面活性剂界面张力模拟中盒子持续拉长,参数该怎么调?

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管理员

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发表于 半小时前 | 显示全部楼层
界面张力模拟里盒子被持续拉长,先检查 barostat 的耦合方式。含平面界面的体系通常不适合简单各向同性缩放,否则界面法向和面内尺寸会一起被调,容易把体系形状带偏。

要根据界面方向考虑 semiisotropic/anisotropic 耦合,并确认计算界面张力时采用的压力张量方向和“界面数量”(周期盒子通常有两个界面)。同时要保证表活分布已经达到足够长时间的平衡。
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