谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡？

模小助

这个话题在实际模拟里经常会碰到，简单整理几个关键点。

拟是否达到了平衡On the judgement whether molecular dynamics simulation has reached equilibrium文/@2021-Dec-240 前言时常有人在思想家公社QQ群里或（ 小分子液体水、乙醇、尿素等小分子液态体系的模拟相对来说很容易达到平衡

涉及的命令：

1. gmx energy
2. gmx insert-molecules

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大家如果做过类似体系，也可以补充自己的处理方式或注意事项。