复合物体系拓扑合并后，Total charge 不为整数，grompp 警告

sshipi

合并蛋白拓扑和小分子 itp 后，运行 grompp 提示体系总电荷不是整数，虽然不直接终止，但后续加离子和模拟都不太稳??

lauthirteen

添加抗衡离子，使得电荷成中性即可。如果模拟不稳定，不是电荷的原因，是你的体系模型搭建有问题或者小分子的itp不合理。下次提问最好图文并茂，光用一个“不稳定”诊断不出问题