找回密码
 立即注册
查看: 23|回复: 1

求助:Residue' not found in residue topology database

[复制链接]

4

主题

0

回帖

14

积分

新手上路

积分
14
发表于 2026-3-10 14:03:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在运行gromacs时候出现下面错误:Residuenot found in residue topology database。请问大家应该如何解决呢?

4

主题

13

回帖

93

积分

管理员

积分
93
发表于 2026-3-10 14:49:24 | 显示全部楼层
这是最常见的错误之一。你输入的PDB文件中包含一个残基名(如配体、非标准氨基酸、特殊修饰基团),但你所选的力场(在.ff文件夹的.rtp文件中)没有这个残基的定义。对于标准残基,检查PDB文件中的残基名是否与力场中的名称一致(例如,有些力场用HIS、HID、HIE区分组氨酸质子化状态)。对于非标准残基,需要制作rtp文件。
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|模拟之家-SimuHome ( 蜀ICP备2023003244号-3 )

GMT+8, 2026-4-18 18:30 , Processed in 0.027613 second(s), 21 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表