通过 ATB 网站构建小分子的拓扑文件后，执行以下 grompp 命令：gmx grompp -f em.mdp

xuanyx

通过 ATB 网站构建小分子的拓扑文件后，执行以下 grompp 命令：gmx grompp -f em.mdp -c solv.gro -r solv.gro -p topol.top -o ions.tpr -maxwarn 4运行时出现报错.
ERROR 1 [file NAD_8BBB_GROMACS_G54A7FF_allatom.itp, line 65]:
Atomtype HS14 not found
在请问：如何正确使用 ATB 生成的拓扑文件，才能避免该报错，并顺利向溶剂化盒子中添加离子？

lauthirteen

需要把ATB网站的力场文件下载下来放到工作目录，然后top里面调用工作目录里面的力场