小分子复合物建模，合并 ITP 拓扑后 grompp 直接报错

xhh

请问各位老师在做蛋白 + 小分子复合物模拟，分别处理完蛋白拓扑、小分子 itp，然后手动合并到 topol.top 里，执行gmx grompp时直接报错，检查了好几遍文件也没找到原因。

• 1、pdb2gmx 处理蛋白，生成蛋白拓扑
• 2、antechamber + parmchk2 生成小分子 itp
• 3、在 top 文件里 #include 小分子 itp，并在 [system] 和 [molecules] 里添加分子数
  报错代码
  

ERROR 1 [file topol.top, line 50]:



  No such moleculetype PROA

lauthirteen

你的top文件里面对于分子名称的定义和itp里面分子名称的定义不一致。